2006年9月17日，中国科学院、山东省人民政府、青岛市人民政府共建中国科学院青岛生物能源与过程研究所协议书签字仪式在济南南郊宾馆举行。全国人大常委会副委员长、中国科学院院长路甬祥与中共山东省委副书记、省长韩寓群、中共青岛市委副书记、常务副市长崔锡柱同志共同签署了《共建协议书》。 协议书确立了中国科学院青岛生物能源与过程研究所的使命与任务、功能与目标、体制与运行，约定了共建三方的投资与支撑工作分工。 路甬祥副委员长就研究所的筹建工作作了重要指示，韩寓群省长、崔锡柱常务副市长分别代表省、市政府讲话，李静海副院长介绍了研究所的筹建情况。 会议期间，路甬祥副委员长等领导同志观看了已通过初选的研究所园区建设规划设计方案及模型、效果图，园区建设项目可行性研究报告书等，听取了王利生所长的建设工作情况的简介。 签字仪式由山东省副省长王军民主持。出席仪式的其他领导还有，中国科学院副院长施尔畏及院办公厅、各主管局、沈阳分院负责同志；山东省人大常委会副主任墨文川、省政府秘书长周齐及有关厅、局负责同志；青岛市副市长王修林、市政府秘书长马泽、副秘书长孙百刚、科技局局长王安民；中国科学院青岛生物能源与过程研究所筹备组组长王利生、副组长吴钢等。 共建协议的签定是中国科学院青岛生物能源与过程研究所发展史上的一个重要里程碑，标志着研究所筹建工作已全方位展开。特别是路甬祥副委员长亲自签署共建协议书，更是为研究所的发展增添了巨大的动力，给予研究所全体筹建人员以极大的鼓舞。 中央、省、市各大新闻媒体对签字仪式作了专题报道。